Bendera berbentuk persegi panjang dengan ukuran panjang 250 cm dan lebar 100 cm atau memiliki panjang 2,5 (dua setengah kali) dari lebarnya.
Terdapat lambang Universitas pada posisi tengah bendera, dengan warna dasar biru (kode #000080) yang memiliki makna kebenaran, percaya diri, bertanggung jawab, dan damai.
Bendera Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan berwarna hijau (kode : #009A44) melambangkan sikap pengasuhan dan harapan masa depan, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)
Bendera Fakultas Syari’ah berwarna hitam (kode : #000000) melambangkan keteguhan dan kewibawaan, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)
Bendera Fakultas Dakwah berwarna cokelat (kode : #764A23) melambangkan ajakan kepada kebenaran, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)
Bendera Fakultas Ushuludin, Adab, dan Humaniora berwarna biru (kode : #00A1E9) melambangkan percaya diri, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)
Bendera Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam berwarna oranye (kode : #F08300) melambangkan kemuliaan dan kebahagiaan, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)
Bendera Program Pascasarjana berwarna ungu (kode : #903F84) melambangkan kearifan, dan tulisan nama Fakultas berwarna kuning (kode : #FFCC00)